El Ministerio de Salud Pública, quien tiene el mandato legal (Ley XVII, Nº 75) de desarrollar el Sistema de Residencias Médicas en los centros asistenciales docentes, de carácter público o privado,  suministrará a la UCAMI los Programas de Residencias en Ciencias de la Salud en ejecución en la Provincia de Misiones, a efectos que la UCAMI proceda a su análisis, estudio y revisión que garanticen la permanente actualización del conocimiento y prácticas asistenciales supervisadas, tendientes a conceder su aval al programa o sugerir cambios, sujetos a la aprobación final del Ministerio.

El Ministerio emitirá, a cada residente, un Certificado de finalización de la Residencia que acredite el cumplimiento del programa de estudio y el logro de las competencias prácticas establecidas en él, avalado por la Universidad.

La UCAMI manifiesta su interés y vocación en contribuir al aporte de profesionales con formación científico-asistencial de excelencia, en la etapa posterior a su egreso, mediante la colaboración con la autoridad de aplicación, mediante la concreción de estudios de posgrado en las diversas especialidades.

La Universidad, en coordinación con el Ministerio, seguirá colaborando con la cesión del espacio físico necesario para el desarrollo del examen de ingreso a las Residencias de Ciencias de la Salud en la Provincia de Misiones, en el marco del Concurso Unificado Nacional de Residencias de Salud gestionado por dicho organismo.